Популярні Пости

Вибір Редакції - 2019

Картографування шляху до покращення виробництва маніобуса

Anonim

Для майже мільярда людей у ​​всьому світі кассада - це основна культура та основне джерело калорій. Рослину легко вирощувати - живці ростуть добре на маргінальних землях - і дуже терпимо до посухи. Для Міністерства енергетики США ці риси та їхні крохмалі якості роблять ілюзію манією як потенційну сировину для виробництва біопалива.

реклама


Незважаючи на те, що манікюр легко вирощувати, він особливо вразливий для рослинних патогенів, що може значно знизити врожайність. Щоб допомогти у вдосконаленні стратегій вирощування цього коренеплоду, команда, яку очолюють дослідники з Каліфорнійського університету в Берклі та дослідники з Об'єднаного інституту геному інфекції DOE (JGI), що називає Науково-дослідний інститут DOE, описують генетичну різноманітність кассу в квітні 18, 2016 р. Розширений он-лайн публікація журналу Nature Biotechnology . Оскільки коріння маніобудування містять 20-40% крохмалю, який на 15-30% менше на виробництво на гектар, ніж крохмаль з кукурудзи, у багатьох частинах світу, зокрема в Африці та Південно-Східній Азії, він являє собою стратегічне джерело відновлюваної енергії - біомасу з який етанол виробляється для транспортування палива. За допомогою геноміки дослідники сподіваються застосувати сучасні стратегії вирощування, які можуть покращити стійкість касової до хвороб та покращити врожайність.

Геном маніобусу було послідовне під егідою програми DOE JGI Community Science і Roche 454 Science Sciences. Оскільки проект послідовності був випущений в 2009 році, дослідники поліпшили його з додатковими даними, щоб розробити послідовність хромосомної шкали, частково, щоб застосувати інформацію для покращення стратегій розведення.

У роботі команда, до складу якої входили післядипломні колективи UC Berkeley Jessen Bredeson та Jessica Lyons та Simon Prochnik і Albert Wu DOE JGI, порівнювали довідковий генос кассави з геномами родичів касторового боба (Ricinis communis), гумового дерева (Hevea brasiliensis), Ceara rubber (Manihot glaziovii), а також 53 вирощуваних і дикорастущих сортів кассави з усього світу. Вони виявили, що генетична різноманітність маніоки, що використовується в нинішніх селекційних спробах, значно скоротилася в Африці, де віруси, такі як хвороба мозаїки маніобуса та хвороба коричневої смужки, вплинули на врожайність багатьох країн. Вони змогли виявити генетичний підпис минулих програм удосконалення маніобуляції, що йдуть до 30-х років минулого століття, які поєднувалися з касовою та камерою Ceara, і збереження цих каучукових областей в Ceara в елітарних різновидах манієнсу означає, що вони надають бажані риси. Вони також з'ясували зв'язок між багатьма культивованими сортами манієву, що може допомогти селекціонерам максимально збільшити генетичну різноманітність у програмах вдосконалення.

"Тут описані варіанти та популяційна структура є важливими вкладами для підходів, що базуються на маркері та геномі на основі вибору, для поліпшення резистентності до хвороб та врожайності цього основного врожаю", зазначає команда.

Генома маніфесту доступна на порталі Phytozome DOE JGI на сайті //phytozome.jgi.doe.gov/.

Стів Роунслі з Dow AgroSciences розповів про геноміку маніпуляції в Геноміки енергетики та навколишнього середовища DOE JGI у 2014 році. Перегляньте відео на //bit.ly/JGI14UMRounsley.

реклама



Джерело історії:

Матеріали надані DOE / Joint Institute of Genome . Примітка. Зміст можна редагувати за стилем та довжиною.


Довідка з журналу :

  1. Джессен V Бредесон, Джесіка Б Ліонс, Саймон Е Prochnik, Г Альберт Ву, Сінді Ма Ха, Ерік Едсінгер-Гонзалес, Джейн Грімвуд, Джеремі Шмуц, Ізмаїл Я Раббі, Хідозі Егезі, Поса Навулула, Вінсент Лебот, Джозеф Ндунгуру, Джефрі Мкаміло, Ребекка С Барт, Тім Л Сеттер, Рослін М Глейдов, Пітер Кулаков, Мораг Е Фергюсон, Стів Руунслі, Даніель С Рохсар. Секвенування дикої та культивованої маніоки та пов'язаних з нею видів відкриває широку міжвидову гібридизацію та генетичну різноманітність . Біотехнологія природи, 2016; DOI: 10.1038 / nbt.3535